Die Sammlung von authentischem Referenzmaterial im Rahmen des Projektes orientiert sich an der Marktrelevanz, an der Differenzierungsmöglichkeit einzelner Arten sowie an der Notwendigkeit zur Überprüfung der Spezifität der zu entwickelnden Methoden. Bisher konnten 23 verschiedene Krustentierarten als authentisches Referenzmaterial aus unterschiedlichen Ländern gesammelt, morphologisch bestimmt und sequenziert (Barcodes) werden.
Real-time PCR-Systeme stehen in vielen Kontrolllaboren zur Verfügung. Als Schnellmethode liefern sie innerhalb weniger Stunden ein Ergebnis. Es wurde ein Multiplex-Verfahren entwickelt, das den gleichzeitigen Nachweis von vier marktrelevanten Krustentierarten erlaubt.
Die Nutzung der NGS-Technologie als weitere DNA-basierte Methode zur Differenzierung von Speziesmischungen, deren genaue Deklaration ebenso gesetzlich gefordert ist, befindet sich derzeit in erster Testung.
Protein-basierte Analyseverfahren mittels LC-MS/MS finden ihre Berechtigung bei ausgewählten Fragestellungen wie der Speziesidentifizierung oder dem Nachweis allergener Proteine. Als erster Schritt wurde eine robuste Probenaufarbeitung entwickelt und etabliert, sodass im Anschluss an die LC-MS-Messung aus den Peptidprofilen ausgewählter Krustentiere Spezies-spezifische und Allergen-spezifische Peptidmarker identifiziert werden können.
Die MALDI-ToF-MS nutzt zur Artidentifizierung den Abgleich Spezies-spezifische Proteinmuster und stellt im Bereich der Mikroorganismen ein bereits etabliertes Schnellverfahren dar. Im Projekt wurde dieses Prinzip erfolgreich für die Anwendung bei Krustentieren optimiert und die Durchführbarkeit dargelegt.